در چندین بیماری نورولوژیکی در حین خواب اختلال عملکردی حنجره رخ می دهد که ناشی از تاثیر ساختارهای فوق هسته ای، هسته آمبیگوس یا اعصاب حنجره ای راجعه است. برای مثال در چندین بیماری دژنره عصبی، به طور اتفاقی یا توارثی، ذکر می شوند، بیماری هایی چون:

Multiple System Atrophy

Spinocerebelar Ataxia

Parkinson

در اغلب این حالات، اختلال عملکردی حنجره در حین خواب، نشانه هایی(Symptom) از بیماری هایی است و حتی گاهی به طور ناگهانی به مرگ در حین خواب منجر می شود.